Isto acontece muito provavelmente porque o arquivo project.json do seu projecto excede o nosso tamanho limite de 5MB. O arquivo project.json contém os dados do seu projecto, incluindo todos os respectivos blocos.
Os arquivos project.json do Scratch 3.0 são maiores que os arquivos project.json do Scratch 2.0. Por isso, se o seu projecto foi guardado pela última vez como projecto Scratch 2, carregá-lo no Scratch 3 fará com que os mesmos dados ocupem um maior espaço. Nesse caso, não será possível guardar o projecto, mas os seus dados antigos continuarão legíveis.
Para resolver o problema, tem de remover conteúdo do seu projecto. Uma forma de o fazer é usar clones para copiar actores em vez de duplicar esses actores. Pode também verificar se há blocos não usados no seu programa, tais como blocos que não estão encaixados numa pilha de blocos.
As nossas desculpas se este problema lhe causar algum inconveniente.